Фамилия Стакян — редкий для русского слуха случай, когда окончание выдает нерусское происхождение. Типичный армянский фамильный суффикс -ян (в старой орфографии — -янц) означает «из рода такого-то» или «принадлежащий». Основа Стак- в таком контексте чаще всего восходит к армянскому слову стак — «стебель», «ствол», «тростник». Вероятно, прозвище Стак дали человеку высокому, тонкому, сухопарому — похожему на тростинку. В армянской ономастике такие «растительные» прозвища не редкость: они описывали внешность, а не род занятий.

Вторая версия, менее распространенная, связывает фамилию с иранским или тюркским заимствованием: в некоторых диалектах стак означало «сосуд», «кувшин» или «чаша». Тогда носитель прозвища мог быть гончаром или торговцем посудой. Но эта гипотеза слабее: в армянском языке для «кувшина» есть более употребительные слова (куж, амфора), и основа стак в значении «сосуд» встречается редко.

Фамилия Стакян не принадлежит к числу массовых армянских фамилий, таких как Петросян или Арутюнян. Она географически «привязана» к западным областям исторической Армении — районам Вана и Муша, где диалектное слово стак бытовало активнее. После геноцида 1915 года носители фамилии рассеялись по диаспоре: их можно встретить в Ливане, Сирии, Армении, а в России — в Краснодарском крае и Ростовской области, где сложились крупные армянские общины.

В русском языке фамилию не склоняют по падежам, если она принадлежит мужчине: «Иван Стакян», «у Ивана Стакян». Для женщины — то же самое: «Анна Стакян», «у Анны Стакян». Ударение в фамилии падает на последний слог — Стакя́н, что типично для армянских фамилий, оканчивающихся на -ян.