Фамилия Станишев — один из ярких примеров того, как славянское личное имя превратилось в фамилию через цепочку уменьшительных форм. В основе лежит славянское имя Станислав (от «стань» и «слава»), но не напрямую. Фамилию образовали от его краткой, разговорной версии — Станиш. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Станишев буквально значит «сын Станиша» или «человек из рода Станиша».

Суффикс -иш в данном случае — не польский или украинский, а скорее южнославянский или западнорусский уменьшительный формант. В болгарском и сербском языках имена на -иш (Радиш, Божиш, Станиш) встречаются часто. В русской традиции такие формы тоже бытовали, но реже, чем на -ка или -ша. Поэтому фамилия Станишев может указывать на южнославянские корни предков — болгар или сербов, переселившихся на территорию Российской империи или живших в смешанных регионах, например, в Бессарабии или Новороссии.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с прозвищем Станиш от глагола «станить» — в некоторых говорах так называли того, кто останавливается, медлит или задерживается. Но ономастика склоняется к антропонимической основе: основная масса фамилий на -ишев/-ишев образована от личных имён, а не от диалектных глаголов.

Географически фамилия Станишев редкая. Встречается в основном на юге России, в Ростовской области и Краснодарском крае, а также среди болгарских переселенцев в Молдове и Одесской области. В центральных русских регионах она почти не фиксируется, что подтверждает гипотезу о её южнославянском происхождении. Носители фамилии — потомки тех, кого в семье звали ласково Станиш, то есть маленький Станислав.