Фамилия Станогина — женская форма, мужская — Станогин. Она образована с помощью типичного русского суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Станоги» или «род Станоги». Основа фамилии — прозвище Станога. В русских говорах слово «станога» означало «нога», но с оттенком устойчивости, крепости: «стать» (туловище) и «нога». Скорее всего, так прозвали человека с крепкими, сильными ногами, либо того, кто много ходил или стоял — например, сторожа, курьера или пешего воина. В некоторых диалектах «станога» могло быть ироничным прозвищем для неуклюжего или косолапого человека.

Менее вероятна, но возможна связь с топонимом — деревня Станогино существует в Костромской области. В таком случае фамилия могла произойти от названия места: «выходец из Станогина». Однако прозвищная версия первична, так как ойконим сам, скорее всего, образован от того же прозвища.

Фамилия редкая, встречается в основном в центральных и северных регионах России — Вологодской, Костромской, Кировской областях. В дореволюционных переписях Станогины чаще всего фиксировались как государственные крестьяне, реже — как мещане. Среди однокоренных фамилий — Станогов, Станожилов, Станогаев, но все они единичны. В отличие от массовых фамилий на -ов, модель на -ин здесь сохраняет древнюю форму прозвища, что говорит о глубоких корнях — возможно, XV–XVI век.