Фамилия Степанидина образована от женского имени Степанида, которое в свою очередь восходит к мужскому крестильному имени Стефан. В переводе с древнегреческого оно означает «венок». Имя Степанида — это народная, «простая» форма церковного имени Стефанида, и именно эта особенность указывает на среду, где возникла фамилия.

Скорее всего, основатель рода был человеком из простого сословия — крестьянином, ремесленником или посадским. В среде духовенства и дворянства чаще придерживались книжного написания имени, поэтому фамилии от формы «Стефанидов» встречаются реже и имеют иной социальный оттенок. А вот форма «Степанида» — живая, разговорная, та, что звучала в повседневной речи. Именно от неё и пошла фамилия Степанидин, а затем и Степанидина.

Обратим внимание на суффикс. Фамилия построена по классической модели «-ин», которая в русском языке указывает на принадлежность: Степанидин — значит «сын Степаниды» или «из семьи Степаниды». Такая модель была самой распространённой в северных и центральных русских землях, где фамилии часто образовывались от имён матерей, если женщина играла заметную роль в хозяйстве или оставалась главой семьи после смерти мужа. Поэтому Степанидины — это потомки женщины по имени Степанида, чьё имя закрепилось за целым родом.

Сам корень имени — Стефан — имел на Руси широкое хождение. От него произошло множество фамилий: Степанов, Степаненко, Степанищев, Стефановский. Фамилия Степанидина стоит в этом ряду особняком: она сохранила не мужскую, а женскую форму имени, что делает её сравнительно редкой и выделяет среди однокоренных. Встречается она преимущественно в тех регионах, где была сильна традиция отчеств от женских имён, — в Поволжье и на русском Севере.

Если говорить о точной дате возникновения, то фамилии такого типа начали закрепляться в XV–XVII веках, а массово распространились после отмены крепостного права в 1861 году, когда бывшим крепостным потребовалось иметь официальные фамилии. Степанидины, как и большинство крестьянских родов, получили свою фамилию именно в этот период — от имени старшей женщины в семье, которую хорошо знали в округе.