Фамилия Степутин образована от имени Степута — одной из множества народных форм канонического имени Степан (греч. Stephanos — «венок», «венец»). Суффикс -ут- в данном случае необычен: чаще встречаются уменьшительные Степа, Степка, Степаня. Форма на -ута (-уть) характерна для западных и южных русских говоров, а также для белорусской и украинской традиции. Она передавала оттенок ласкательности или, напротив, шутливо-фамильярного обращения. Так что Степута — это примерно то же, что «Степашка» или «Степушка», только с иным диалектным колоритом.

Суффикс -ин в финале указывает на принадлежность: Степутин — «сын Степуты» или, шире, «человек из рода Степуты». Такая модель типична для северных и центральных областей Руси, где фамилии на -ин образовывались от основ на -а/-я. В южных регионах чаще встречается вариант Степутинский (с польским или украинским влиянием), но сама фамилия Степутин — исконно великорусская.

Географически фамилия редкая. Основной ареал — Курская, Воронежская, Белгородская области, где до сих пор бытуют говоры с характерным «аканьем» и формами вроде Степута. Встречается также в Сибири, куда переселенцы из черноземья увозили свои прозвища в XVIII–XIX веках.

Ономастический словарь Б. Унбегауна упоминает фамилию Степутин в ряду образований от уменьшительных форм Степана, но без подробного разбора. В источниках XVII века фигурируют крестьяне и посадские люди с именем Степута — например, в переписных книгах Ельца (1646 год) отмечен «Степута Иванов сын, плотник». Это указывает на социальную среду: фамилия возникла в среде свободных крестьян, ремесленников и низшего духовенства, а не в дворянской среде.

Спорных версий происхождения у фамилии нет: корень прозрачен, а альтернативные гипотезы (например, от тюркского «степь» или польского «stępować» — ступать) лингвистически несостоятельны, так как суффикс -ут- в русской антропонимии чётко привязан к христианским именам.