Фамилия Стокусов — редкий случай, когда в основе лежит не русское, а литовское слово. Вопреки ожиданию, её не связывают ни со стуком, ни с «током», ни с каким-либо ремеслом, обозначенным через суффикс -ус-. Разберёмся по порядку.

Корень фамилии — «стокус». В русском языке такого слова нет, зато в литовском есть stokus — «толстый», «тучный», «плотный». Это прозвище по внешности: так могли назвать коренастого, грузного человека. Фамилия образована по русской модели: к литовской основе добавили патронимический суффикс -ов, означающий «чей?» — то есть сын Сто́куса. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Сто́кусов.

Такие фамилии — свидетельство давних контактов между русскими и литовцами, особенно в западных губерниях Российской империи (Виленской, Ковенской, Гродненской) и на территории современной Беларуси. Там осевшие в русской среде литовцы или белорусы могли получить прозвище, которое затем закрепилось как фамилия. Встречаются варианты написания: Стокус, Стокусов, а также Стокусович — последний более характерен для белорусской традиции.

Ономастика указывает, что фамилии на -усов, как правило, имеют балтское или польское происхождение. В словаре Б. Унбегауна подобные примеры разбираются в контексте «литовско-русских» фамилий: прозвище на -ус превращалось в русскую фамилию через суффикс -ов. Никакой другой, более распространённой версии (например, от имени Сток или от слова «стук») у фамилии Стокусов нет — они не выдерживают лингвистической проверки, так как не дают объяснения суффиксу -ус.

Таким образом, предок носителя фамилии Стокусов был человеком плотного телосложения, жившим в зоне русско-литовского пограничья. Фамилия не дворянская и не крестьянская по происхождению — она из числа прозвищных, которые встречались в разных сословиях.