Фамилия Столбуник — редкий пример, где суффикс указывает на профессию или прозвище точнее, чем корень. В отличие от массовых Столбовых, Столбцовых или Столбиковых, эта фамилия образована с помощью суффикса -ник, который в русском языке почти всегда означал лицо по роду занятий (охотник, работник, печник). Соответственно, Столбуник — это не просто «человек, имеющий отношение к столбу», а конкретный мастеровой: тот, кто делал столбы, ставил их или, возможно, жил у придорожного верстового столба, неся за него ответственность.

Слово «столб» в XVI–XVII веках имело и узкое юридическое значение. Столбами называли межевые знаки, разделявшие земельные владения. Столбуником могли прозвать крестьянина или служилого человека, который следил за целостностью этих границ или устанавливал их по указу помещика. В северных и центральных губерниях России, где было развито столбовое (межевое) землепользование, такая фамилия могла возникнуть в среде черносошных крестьян или однодворцев — сословия, грамотного в земельных вопросах.

Суффикс -ник встречается в фамилиях гораздо реже, чем -ов или -ин, что делает Столбуника ономастически ценным. По модели образования он стоит в одном ряду с фамилиями Рыбник, Плотник, Скорняк, но с той разницей, что исходное слово «столб» не называет ремесло напрямую — его пришлось переосмыслить. Это говорит о том, что прозвище было не случайным, а устойчивым и, скорее всего, передавалось по наследству ещё до отмены крепостного права.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Основные очаги — Псковская и Тверская области, что косвенно подтверждает связь с межеванием: именно в этих землях в XVII веке активно проводилось описание границ поместий и вотчин. Вариантов написания практически нет: форма Столбуник застыла, не перейдя в Столбуников, что тоже характерно для фамилий, образованных от прозвищ на -ник, — они нередко сохраняли исходный вид без дополнительного патронимического суффикса.