Фамилия Столбунская — женская форма фамилии Столбунский, которая образована от названия населённого пункта. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев и -ин, которые произошли от имени или прозвища отца, фамилии на -ский/-цкий в массе своей дворянские или польские по происхождению. Но Столбунская не обязательно указывает на шляхетское прошлое: на рубеже XVIII–XIX веков такие фамилии давали семинаристам по названию их родного села или по церковному приходу.

Корень «столб» здесь, скорее всего, не в прямом значении «вертикальная опора», а в топонимическом — как часть названия села или урочища. В России и Беларуси есть несколько деревень с названием Столбуны, Столбун, Столбунцы. Самое известное — село Столбун в Ветковском районе Гомельской области, которое упоминается ещё в XVI веке. Название могло произойти от диалектного «столбун» — стоячий камень, межевой знак, или от речки Столбунка. Жителей таких мест называли столбунцами, а их потомки, переезжая в города, получали фамилию Столбунские.

Есть и другая версия, менее вероятная: от прозвища Столбун — так в некоторых говорах называли высокого, неповоротливого человека, «стоящего столбом». Но фамилии на -ский редко образуются напрямую от прозвищ — для этого есть суффикс -ов/-ин. Если бы предка прозвали Столбуном, он стал бы Столбуновым, а не Столбунским. Поэтому географическое происхождение фамилии выглядит убедительнее.

Фамилия Столбунская встречается нечасто, преимущественно в юго-западных областях России и в восточной Беларуси. Носительницы этой фамилии могут иметь корни из тех мест, где когда-то стоял «столбун» — межевой камень или укреплённый столб на границе владений.