Фамилия Ступин в своей основе имеет прозвище Ступ, которое восходит к глаголу «ступать». Чаще всего Ступом в старину называли человека с тяжелой, медленной походкой, того, кто грузно ступал при ходьбе. Эта версия происхождения считается наиболее распространенной и логичной.

Однако существует и другой, менее очевидный путь образования. Слово «ступа» в русском языке также обозначало прочный сосуд, обычно деревянный или металлический, который использовали для толчения зерна, круп и других продуктов. В этом случае прозвище Ступ могло закрепиться за мастером, который вытачивал или выдалбливал такие ступы, либо за человеком, который постоянно пользовался этой утварью в хозяйстве. Вторая версия правдоподобна, но уступает первой по частоте: личные прозвища, данные по манере движения, встречались гораздо чаще, чем прозвища, связанные с конкретным предметом домашнего обихода.

Словообразовательная модель фамилии простая и характерная для русского севера и центральной России: к основе Ступ добавили притяжательный суффикс -ин, который указывал на принадлежность роду. Первоначально Ступин означало «сын Ступа» или «человек из семьи Ступа». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на согласный звук.

Интересно, что фамилия Ступин не имеет отношения к глаголу «ступить» в значении «сделать шаг» в переносном смысле. Она не связана с каким-либо социальным статусом или сословием — прозвище Ступ могли дать и крестьянину, и ремесленнику, и служилому человеку. В документах XVI–XVII веков встречаются разные люди с этим прозвищем, что подтверждает его широкое бытование среди разных слоев населения.

В современном русском языке фамилия Ступин нередко воспринимается как «говорящая», связанная с походкой, что делает ее запоминающейся и легко объяснимой. При этом редкий вариант происхождения от слова «ступа» добавляет фамилии глубину и напоминает о бытовой культуре наших предков, где деревянная ступа была незаменимым предметом в каждом доме.