Фамилия Сунин — яркий пример «семейной» фамилии, образованной напрямую от личного имени или прозвища. Её основа, Суня, — это не полное календарное имя, а уменьшительно-ласкательная или просторечная форма. Чаще всего её выводят от имени Александр (через цепочку: Александр → Саня → Суня) или от имени Арсений (Арсений → Сеня → Суня). В русской ономастике такой переход «с» в «с» и чередование гласных — обычное дело для народной речи.

Модель образования проста и продуктивна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Сунин буквально значила «чей?» — «Сунин», то есть сын, потомок или человек из семьи Суни. В среде крестьян и посадских людей такие фамилии закреплялись в XVI–XVII веках, когда отчество на -ин ещё не было фиксированной фамилией, а указывало на конкретного отца. Позже оно превратилось в наследственное имя рода.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается в старых переписях Вологодской, Костромской и Нижегородской губерний. В этих краях было много Арсениев и Александров, а местные говоры любили усекать имена до коротких, энергичных форм.

Менее вероятна, но возможна версия от прозвища Суня, связанного с диалектным словом «суня» — так в некоторых говорах называли сонного, медлительного или рассеянного человека. Однако в пользу «именитой» версии говорит то, что фамилии на -ин от прозвищ обычно возникали позже и реже, чем от крестильных имён. В любом случае, в основе лежит живое, разговорное слово, а не книжное или служебное.

Редкость фамилии в том, что она не перегружена однокоренными вариантами. В отличие от фамилий вроде Сунинский или Сунов, которые могли бы указывать на место, Сунин — чисто патронимическая, «сыновья» фамилия. Носители её — потомки человека, которого в быту звали просто Суня, и это имя, сокращённое до трёх букв, пронесло память о нём через века.