Фамилия Супонькина — женская форма фамилии Супонькин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт нестоличное, диалектное происхождение. Суффикс -кин (вместо более распространённого -ин) в русских фамилиях нередко указывает на северные или восточные регионы, а также на то, что основа слова оканчивалась на -а или -я. В случае с Супонькиным основа — «Супоня» или «Супонька» — прозвище, которое и легло в фамилию.

Само прозвище «Супоня» восходит к слову «супонь» — это ремень, которым затягивают хомут на лошади. В крестьянском быту супонь была деталью упряжи, и человека могли прозвать Супоней за манеру туго затягивать пояс, за скрипучий голос (напоминающий скрип кожи) или за характер — «супониться» в говорах означало хмуриться, сердиться, затягиваться, как ремень. Таким образом, носитель фамилии Супонькин — потомок человека, которого окрестили по детали конской сбруи или по его угрюмому нраву.

Интересно, что фамилия Супонькин встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской, Костромской и Архангельской губерниях, где супонь как бытовой термин была в ходу. Это не дворянская, а крестьянская или мещанская фамилия, образованная от мирского прозвища — распространённая модель среди непривилегированных сословий. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто шли от полных имён, -кин указывает на уменьшительную или пренебрежительную форму, что подчёркивает бытовой, неофициальный характер прозвища.

Словообразовательный ряд однокоренных фамилий — Супонев, Супоняев — показывает, что основа «супонь» дала несколько вариантов, но Супонькин — самый редкий и диалектный, с двойным смягчением: суффикс -к- и окончание -ин. Это говорит о том, что прозвище бытовало в форме «Супонька», то есть с ласкательным или уничижительным оттенком. В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) такие фамилии разбираются как типичные для «прозвищного» слоя, где человек получал имя по предмету, действию или черте, а не по имени отца.

Документальных упоминаний о конкретных носителях фамилии Супонькина в открытых источниках мало, что неудивительно: это редкая, локальная фамилия, не попавшая в общероссийские родословные книги. Если искать её в метрических книгах XIX века, скорее всего, она окажется в записях крестьян одной-двух волостей на севере или северо-востоке России. Для человека, носящего эту фамилию, ключ к истории рода — именно географическая привязка к региону, где «супонь» была в обиходе, и понимание, что предок был, вероятно, либо конюхом, либо просто угрюмым мужиком, которого за глаза звали Супоней.