Фамилия Сушкинова — женская форма от Сушкинов, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Сушка, которое в древнерусской традиции давали не по внешности, а по характеру: так могли назвать сухого, поджарого человека или, наоборот, того, кто «сушит» — дотошного, скупого, неразговорчивого. Слово «сушка» в говорах означало не только маленькую булку, но и сухощавого человека, а также — в переносном смысле — «сухаря» по натуре. От Сушки через притяжательный суффикс -ов образовалась фамилия Сушков, но в варианте Сушкинов мы видим двойной суффикс: -ин- + -ов. Это редкая, но не уникальная модель: сначала от основы Сушк- с помощью -ин сделали прилагательное «Сушкин» (чей? — Сушкин сын), а затем добавили -ов по аналогии с массовыми фамилиями на -ов. Такая цепочка встречается в северных и центральных регионах, где фамилии нередко «наращивали» суффиксы под влиянием документальной записи.

Географически фамилия Сушкинов (и Сушкинова) встречается нечасто: она рассеяна по средней полосе России, с заметным пятном в Поволжье — в Татарстане и соседних областях. Это может указывать на то, что предки носителя фамилии были выходцами из крестьянской среды, где прозвища закреплялись в семьях, а при переписях и ревизиях их записывали с разными суффиксами. В отличие от распространённых Сушковых, Сушкиновы — более локальная ветвь, и её носители, вероятно, происходят из одного родового гнезда, а не из множества независимых очагов.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда Сушкинова пытаются связать с профессией сушильщика (того, кто сушил зерно, рыбу или лес), но тогда основа была бы Сушил- или Суш- с другим суффиксом. Сушка как прозвище — объяснение более естественное и подтверждается типовыми моделями русских фамилий. Если сравнивать с однокоренными — Сушков, Сушин, Сушкин, — то Сушкинова стоит особняком из-за двойного суффикса, и это как раз та деталь, которая делает фамилию не просто вариантом, а отдельной ономастической загадкой: здесь видна рука писаря, который механически прибавил -ов к уже готовой фамилии Сушкин, чтобы «подогнать» её под стандарт.