Фамилия Суслеганов — редкая и географически привязанная. Её основа — тюркское слово «суслеган» или «суслегэн», которое в переводе с татарского и башкирского означает «выдра». В тюркских языках «сусле» — «водяной, водный», а «ган» — суффикс, образующий прилагательное или существительное. Таким образом, прозвище Суслеган давали человеку, который либо внешне напоминал выдру (например, был подвижным, ловким, с влажным блеском глаз), либо промышлял охотой на этого зверя. Выдра ценилась за мех, и охота на неё была отдельным ремеслом.

Модель образования фамилии — типично русская, с суффиксом принадлежности -ов. Суффикс указывает на то, что первый носитель фамилии был сыном или потомком человека по прозвищу Суслеган. Фонетически фамилия могла претерпеть изменения: в русском языке конечный звонкий «г» в основе (Суслеган) перед суффиксом -ов остался без изменений, но в разговорной речи возможны варианты с оглушением — Суслеканов, хотя они не зафиксированы в массовом порядке.

География фамилии узкая. Суслегановы встречаются почти исключительно в Башкортостане и прилегающих районах Оренбургской области, а также среди башкирских и татарских переселенцев в Челябинской области. Это наводит на мысль, что фамилия возникла в среде башкир или казанских татар, которые приняли русскую модель фамилии через суффикс -ов, но сохранили тюркское прозвище в основе. В метрических книгах XIX века такие фамилии часто писали с двойным написанием — Суслеганов и Сюслеганов, что отражает неустойчивость передачи тюркского звука «ү» (близкого к русскому «ю»).

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к государственным крестьянам или тептярям — особой категории нерусского населения Урала, не входившей в крепостную зависимость. Встречаются упоминания Суслегановых в ревизских сказках Уфимской губернии середины XIX века как жителей деревень, где основным занятием было скотоводство и охота. Таким образом, фамилия — не про знатность, а про меткое прозвище, данное за сходство с лесным зверем или за ремесло зверолова.