Фамилия Сусяев — одна из тех, где корень неочевиден, а суффикс задаёт направление поиска. Окончание -ев указывает на принадлежность к патронимической модели: так образовывали фамилии от имён или прозвищ, заканчивающихся на мягкий согласный или -й. Основа здесь — Сусяй, а это, скорее всего, обиходная форма какого-либо крестильного имени.

Если отталкиваться от тюркских корней, которые часты в фамилиях Поволжья и Приуралья, имя Сусяй могло быть искажением имени Сулейман (Соломон) — в татарской и башкирской среде его нередко сокращали до Суся, Сусяй. Тогда фамилия означает «потомок Сусяя», то есть человека, носившего такое домашнее имя. Вторая версия, менее вероятная, но возможная: связь с диалектным глаголом «сусять» — в некоторых говорах так говорили о том, кто шепчет, бормочет, говорит невнятно. В этом случае Сусяй — прозвище неразговорчивого или тихого человека, а фамилия закрепилась за его детьми.

Географически фамилия редкая, встречается точечно в Удмуртии, Татарстане и соседних областях. Это косвенно подтверждает версию о тюркском происхождении: в этих регионах имя Сулейман было распространено, а фамилии на -ев от местных прозвищ — обычное дело. Известных носителей с такой фамилией в истории нет, так что перед нами типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия, возникшая в XIX веке при массовой паспортизации.

Словообразовательный нюанс: если бы основа оканчивалась на твёрдый согласный, мы бы увидели Сусяев — с суффиксом -ов, но мягкий звук в корне дал именно -ев. Это же правило работает для фамилий вроде Андреев или Матвеев, где основа тоже оканчивается на -й. Так что фамилия Сусяев — не исключение, а аккуратный пример стандартной русской патронимической модели, наложенной на нерусское по происхождению имя.