Фамилия Святынина — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а отвлечённое понятие. Она образована по стандартной модели: от слова «святыня» с помощью патронимического суффикса -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?»). Святынин — сын Святыни, то есть человека, которого прозвали Святыней. Но что могло значить это прозвище?

Самое прямое объяснение — прозвище дали человеку набожному, строгому в вере, возможно, даже аскету. В диалектах слово «святыня» могло относиться не только к церковным предметам, но и к человеку, которого в округе почитали за праведность или считали «не от мира сего». Однако есть и другая версия, менее очевидная, но более житейская: в некоторых говорах «святыней» называли крестника или крестницу — того, кого «освятили» при крещении. Так могли прозвать ребёнка, которого часто брали крёстными, или же самого восприемника.

Словообразовательный тип фамилии — «отвлечённое существительное + -ин» — встречается нечасто. Сравните с фамилиями Истинин, Правдинин или Веригин, но в случае со Святыниной основа лишена бытового оттенка и несёт отчётливый религиозный подтекст. Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России, где были сильны старообрядческие общины: в среде староверов подобные прозвища, подчёркивающие благочестие, давали охотнее.

В документах фамилия встречается с XVIII века, преимущественно среди крестьян и мещан. Дворянских родов Святыниных не зафиксировано — это «народная» фамилия, возникшая в среде, где церковная лексика была частью повседневной речи. Сейчас она редка, и её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных гнёзд — например, из бывшей Вологодской или Костромской губернии, где «святыня» как прозвище могло закрепиться за целым родом.