Фамилия Тимоненкова — женская форма от Тимоненков, и её разбор стоит начать с редко встречающегося суффикса -енк-. В русской ономастике это уменьшительно-уничижительный или, чаще, «малый» формант: он указывает на потомка или человека, связанного с кем-то по имени Тимоня. Сама основа — Тимоня — это производная форма от канонического имени Тимофей (греч. Timotheos — «почитающий Бога»). В народной речи имя дробилось на десятки вариантов: Тимоха, Тимоша, а Тимоня — одна из обиходных форм, характерная для северных и центральных говоров.

Суффикс -енков (в женском роде -енкова) типичен для фамилий, которые оформлялись по модели «чей сын?»: Тимоня → Тимоненок («маленький Тимоня») → Тимоненков. Такая модель особенно активна была на территории бывшего Великого княжества Литовского и в южнорусских землях, но встречается и в тверских, псковских, смоленских областях. В отличие от фамилий на -ов (Тимонов) или -ин (Тимонин), форма на -енков подчёркивает не прямое отчество, а скорее принадлежность к роду через прозвище или уменьшительное имя.

Исходное прозвище Тимоня могло закрепиться за человеком не только как домашнее имя. В некоторых диалектах «тимоня» — ленивый, медлительный человек (от глагола «тимонить» — мешкать, тянуть). Но эта версия слабее: фамилии от прозвищ с таким значением редки, а имя Тимофей было настолько распространено среди крестьян и духовенства, что церковная основа остаётся главной.

Сословно Тимоненковы — почти наверняка крестьянский род. Фамилии на -енков редко встречаются у дворянства, которое тяготело к формам на -ский и -ов. В переписных книгах XVII–XVIII веков носители фамилии фиксируются в однодворческих и крестьянских общинах Курской, Орловской и Тамбовской губерний. Встречается также вариант Тимоненко — без наращения -в, что типично для украинской и южнорусской ономастики, но женская форма Тимоненкова указывает на адаптацию именно в великорусской среде.

Географически сегодня фамилия сосредоточена в Белгородской, Курской и Воронежской областях, а также в ряде районов Сибири, куда переселенцы уходили в XIX веке. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка был крестьянином из чернозёмной полосы, а его далёкий тёзка — Тимофей по крещению, которого в быту звали Тимоней.