В основе фамилии Тимонова лежит не церковное, а мирское имя Тимон — так в старину могли сокращенно называть человека, носившего каноническое имя Тимофей. В переводе с древнегреческого Тимофей означает «почитающий Бога», и это имя было в прошлом нередким. Уменьшительная форма Тимон, а также родственное ему имя Тимон (от греческого «почитающий») и дали начало фамилии. Потомок человека, которого в быту звали Тимоном или Тимошей, со временем получал фамилию Тимонова.

Словообразовательная модель здесь простая и понятная: к основе Тимон добавился типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность роду, а затем и окончание -а для женской формы. Такой способ формирования фамилий был широко распространен в центральной России, поэтому фамилия Тимонова встречается в разных регионах, но особенно часто — в областях, где имя Тимофей было популярно среди крестьян и посадских людей.

Интересно, что фамилия Тимонова имеет родственные варианты: Тимонин, Тимохин, Тимошин, Тимофеев. Все они восходят к одному корню, но разные суффиксы указывают на разные уменьшительные формы имени. Если Тимофеев — прямая отсылка к полному церковному имени, то Тимонова сохранила именно народное, обиходное звучание. Это делает фамилию более «живой», отражающей повседневную речь предков, а не только церковную традицию.

Процесс формирования фамилий был длительным, и окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Тимоновых можно лишь на основании генеалогических исследований. Но уже сейчас ясно: фамилия не дворянская и не книжная, а исконно народная, возникшая в среде, где имя Тимофей было обычным, а ласковое или сокращенное обращение Тимон закреплялось за человеком на всю жизнь.

В написании фамилии есть одна особенность: ударение в ней может падать и на первый, и на второй слог, в зависимости от местной традиции. Это тоже следствие устного бытования имени Тимон — в разных говорах его произносили по-разному, и фамилия сохранила эту вариативность.