Основой фамилии Тимонов послужило церковное имя Тимон. Фамилия Тимонов образована от имени Тимон, что переводится с древнегреческого как «почитающий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Тимон, со временем получил фамилию Тимонов.