Фамилия Тишканин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, стоит начать не с корня, а с суффикса. Формант -ин указывает на принадлежность: «чей ты будешь?» — «Тишканин», то есть сын или потомок Тишкана. Значит, в основе лежит личное имя или прозвище Тишкан.

Само имя Тишкан — это, скорее всего, уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Тихон. В русской народной традиции Тихона могли называть Тиша, Тишка, а от «Тишки» образовать новую форму с суффиксом -ан (как Иван — Иван, Степан — Степан, но здесь он придаёт дополнительный оттенок просторечия или ласки). Получается цепочка: Тихон → Тишка → Тишкан → Тишканин. Фамилия буквально означает «потомок Тишкана», то есть человека, которого в быту звали ласково или пренебрежительно Тишканом.

Впрочем, есть и другая версия. В северных и сибирских говорах слово «тишкать» могло означать «тихо говорить», «шептать», а «тишкан» — тихоня или молчун. Если это прозвищная фамилия, то её родоначальник получил её за свой спокойный, нешумливый нрав. Обе версии не противоречат друг другу: и имя Тихон, и прозвище «тишкан» несут один и тот же смысловой оттенок — «тихий».

Географически фамилия явно не столичная. Тишканины встречаются в основном в центральных областях России и в Поволжье, где имя Тихон было особенно популярно среди крестьян. В дореволюционных переписях эта фамилия почти не фиксируется в дворянских родословных — она характерна для крестьянской и мещанской среды. Фамилия образована по продуктивной модели, но с редким промежуточным звеном: не Тишкин (от Тишки), а Тишканин (от Тишкана), что делает её заметной среди однокоренных.