Фамилия Тишканина — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной и единственной. В русской ономастике большинство фамилий на -ин образованы от мужских прозвищ или имен: Тишка → Тишкин → Тишкина. Но здесь — Тишканин, то есть принадлежащий Тишкане. А Тишкана — это не имя, а скорее всего, женское прозвище или уменьшительная форма от имени Тихон (через «Тиша», «Тишка») с суффиксом -ан-, который в разговорной речи придавал оттенок ласкательности или, наоборот, пренебрежения. То есть Тишкана — это «та, кого ласково звали Тишкой».

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: основа могла быть отчества от мужского имени Тишкан (редкий вариант Тихона в южнорусских или украинских говорах). Тогда Тишканин — «чей?» — сын Тишкана. Но в таком случае мы бы ожидали фамилию Тишканов, а не Тишканин. Суффикс -ин указывает на принадлежность конкретному лицу, чаще женщине, поэтому первая версия логичнее: прозвище Тишкана дали женщине, а её дети или муж получили фамилию Тишканины.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодчина, Архангельская область, Кировская область. Там суффикс -ин в фамилиях распространён шире, чем на юге, и женские прозвища в основе — не редкость. В дореволюционных переписях Тишканины встречаются среди государственных крестьян и ремесленников, дворянских родов с такой фамилией нет.

Интересная деталь: в некоторых говорах «тишка» означало не только уменьшительное от Тихон, но и прозвище тихого, спокойного человека. Если прозвище Тишкана дали женщине, она могла быть молчаливой, кроткой или, наоборот, иронично — слишком шумной, в пику имени. Но без документов XVII–XVIII века это лишь догадка.

Сравните с однокоренными: Тишкин, Тишков, Тишаков — все они от мужских форм. Тишканина стоит особняком, и это делает её ценной для историков языка: она сохранила архаичную модель образования фамилии от женского прозвища, которая в XIX веке почти исчезла.