Фамилия Тишкунова — женская форма фамилии Тишкунов, и её разбор стоит начать с суффикса, который редко встречается в русских фамилиях. Модель «Тишкун + ов» нетипична: суффикс -ун в русском языке обычно образует названия лиц по действию (бегун, крикун, ворчун), а также прозвища по характерному признаку. В данном случае основа «Тиш-» почти наверняка восходит к уменьшительной форме крестильного имени Тихон (от греческого «тихе» — судьба, удача). Тихон в народной речи давал множество производных: Тиша, Тишка, Тишко, а форма Тишкун — это уже вторичное образование, где суффикс -ун добавляет оттенок фамильярности или прозвищности. То есть Тишкун — это «тот, кого зовут Тишка» или «человек из рода Тишек», но с экспрессивным оттенком.

Обратим внимание на географию. Фамилия Тишкунов (и Тишкунова) исторически привязана к южнорусским и украинским землям, особенно к Курской, Воронежской, Белгородской областям, а также к Слобожанщине. В этих местах суффикс -ун в фамилиях встречается чаще, чем в северных регионах, и нередко указывает на украинское или смешанное русско-украинское происхождение. В украинском языке суффикс -ун продуктивен для прозвищ (співак — співакун, хвалько — хвалькун), и Тишкун могло быть именно таким прозвищем: «Тишкун» — не просто Тишка, а человек с каким-то заметным качеством, связанным с тихостью или, наоборот, с ироничным обыгрыванием имени.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «тишкать» (тихо говорить, шептать) или «тишина». Тогда Тишкун — прозвище молчуна или тихого человека. Однако ономасты (в частности, словарь Б. Унбегауна «Русские фамилии») указывают, что подавляющее большинство фамилий на -ун образовано от личных имён, а не от нарицательных слов, поэтому версия с именем Тихон выглядит убедительнее.

В дореволюционных метрических книгах фамилия Тишкунов встречается преимущественно среди крестьян и мещан, то есть сословный потолок здесь невысокий. Это не дворянская фамилия, а типичная фамилия-прозвище, которая закрепилась за родом в XVII–XIX веках. Её женская форма Тишкунова, по правилам русской грамматики, склоняется как прилагательное (Тишкуновой, Тишкунову) и не меняется при замужестве — то есть женщина может носить её как в девичестве, так и в браке, если не меняет фамилию.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Тишков, Тишкин, Тищенко, Тишунин), то Тишкунов стоит особняком именно из-за редкого суффикса -ун. Это не массовая фамилия, а скорее локальная, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если ваши предки Тишкуновы — с большой вероятностью они родом из чернозёмной полосы России или восточной Украины.