Фамилия Толубец — редкий пример, где разбор упирается не столько в основу, сколько в суффикс. Если вы встречали фамилии Толубьев, Толубеев или Толубаев, то заметили, что они образованы стандартно — через -ев/-ов. «Толубец» же держится на суффиксе -ец, который в русских фамилиях встречается реже и почти всегда указывает на географическое происхождение или принадлежность к чему-либо (ср. донец, кубанец, воронежец). Скорее всего, Толубец — это прозвище человека, который пришёл из места с названием Толубы, Толубь или Толуба. Такие топонимы могли существовать в западнорусских или украинских землях, где суффикс -ец особенно активен.

Сама основа «толуб» неочевидна. Вероятнее всего, это диалектный вариант слова «голубь». В южнорусских и украинских говорах приставной «т» перед начальным гласным — явление известное: «толуб» вместо «голуб» фиксируется в курских и орловских говорах. Тогда Толубец — это «голубец», то есть либо человек, похожий на голубя (кроткий, быстрый), либо держатель голубятни. Менее вероятная версия — связь с «толубой» (толстый, пухлый), но это слово ни в одном из словарей не закреплено.

Фамилия нечастая, но не исчезнувшая. Встречается на Украине (особенно в Черниговской и Сумской областях) и в приграничных областях России — Брянской, Курской. Это косвенно подтверждает версию с украинским или южнорусским корнем. Социально фамилия, скорее всего, крестьянская: суффикс -ец в такой модели не использовался дворянством, а закреплялся за выходцами из конкретных сёл или за людьми с бытовым прозвищем.

Если сравнивать с однокоренными, то Толубец стоит особняком. Толубьев или Толубеев — это «чей-то сын» (чей? — Толуба), а Толубец — «кто такой?» (сам прозывается Толубцом). В паспортной записи XIX века такую фамилию могли дать одному человеку, а его дети уже записывались Толубцевыми, но в реальности форма на -ец часто застывала и передавалась без изменений. Так что если вы Толубец, то ваш предок, скорее всего, носил прозвище «Толубец» (маленький голубь или пришлый из Толуб) — и фамилия не успела перейти в более привычный ряд на -ов.