Фамилия Томаркова — женская форма фамилии Томарков, и её происхождение связано с прозвищем или именем, которое в основе лежит за пределами привычного славянского именослова. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён (Иван — Иванов), корень «Томар» не встречается в православных святцах. Это сразу указывает на то, что предки носителей фамилии могли быть не из центральной России, а из регионов, где смешивались разные языковые и этнические традиции.

Скорее всего, основа — тюркское или кавказское личное имя Томар (Тумар, Домар). В тюркских языках «томар» (тумар) означает «амулет», «оберег», «ладанка» — маленький мешочек с молитвой или магическим предметом, который носили на груди. Такие имена-обереги были распространены у татар, башкир, народов Кавказа: давая ребёнку имя со значением «защита», родители верили, что оно убережёт от злых сил. От этого имени и возникла фамилия Томарков: сначала прозвище Томар, потом — «сын Томара», то есть Томарков, а затем и женская форма Томаркова.

Менее вероятна, но возможна версия от греческого имени Фома (Фома — Тома) с заменой «ф» на «т» в просторечии. Тогда Томар — это местная форма Фомара (Фомы), а фамилия означала бы «Фомин». Однако греческая гипотеза слабее: в русских говорах форма «Томар» для Фомы не зафиксирована, а вот тюркский «тумар» встречается в ономастике Поволжья и Приуралья. Поэтому основной версией остаётся прозвище-оберег.

Географически фамилия Томаркова редкая. Её можно встретить в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области, а также среди потомков казанских татар и чувашей, перешедших в православие. Суффикс -ов/-ев в данном случае не указывает на дворянство или крестьянство — это стандартная модель для фамилий, которые оформлялись в XV–XVII веках у всех сословий. Встречаются и варианты написания с одной «р» (Томакова), но это уже искажение при переписи.

Таким образом, Томаркова — фамилия, которая хранит память о древнем обычае защиты через имя. Предок носителя фамилии, вероятно, жил на стыке славянского и тюркского миров, и его прозвище Томар («оберег») со временем стало родовым знаком.