Фамилия Тонкович образована от личного имени или прозвища, а не от названия профессии или места. В её основе лежит имя Тонко, которое чаще всего считают уменьшительной формой крестильного имени Антон. Само имя Антон восходит к древнегреческому слову anteo — «вступать в бой, состязаться». За этим именем стоит несколько святых покровителей. Один из них — мученик Антонин-воин, который, увидев казнь Георгия Победоносца, уверовал во Христа и после страшных пыток был сожжён в 303 году. Другой — святой отрок Антонин, один из семи отроков Эфесских, замурованных гонителями христиан в V веке. Согласно преданию, он проспал в пещере сто семьдесят лет, а пробудившись, рассказал о себе и своих мучениях и через несколько дней скончался.

Суффикс -ович в фамилии Тонкович указывает на отчество: так называли сына, внука или потомка человека по имени Тонко. Эта модель типична для украинских, белорусских и польских фамилий, где она была распространена шире, чем в великорусских землях. Поэтому фамилия Тонкович с большой вероятностью имеет западнорусские или украинские корни.

Есть и вторая версия происхождения. Основа Тонко могла быть не сокращением от Антона, а прозвищем Тонкой, которое давали человеку за внешние особенности — худощавое телосложение, тонкий стан. В этом случае фамилия Тонкович — это прямое указание на то, каким был предок, а не на его имя, данное при крещении. Обе версии имеют право на существование, но первая, от имени Антон, выглядит более убедительной: уменьшительные формы крестильных имён в фамилиях встречаются гораздо чаще, чем прозвища по внешности, и имя Тонко как народная форма Антона зафиксировано в исторических документах.

Так или иначе, потомок человека, которого звали Тонко или дразнили Тонким, со временем получил фамилию Тонкович. Сегодня она встречается в основном в Беларуси, на Украине и в западных областях России, что подтверждает её происхождение из тех земель, где отчества на -ович были обычным делом.