Фамилия Топонцева — женская форма мужской фамилии Топонцев. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Топонец. Словообразовательная модель здесь не самая частая: суффикс -ец указывает на носителя признака, а окончание -ев (в мужском варианте) — на типичную патронимическую форму XIX века, то есть «сын Топонца».

Корень «топ-» многозначен. Самая прямая версия — от глагола «топтать». Топонцем в русских говорах могли назвать человека с тяжёлой, грузной походкой, который «топает». В рязанских и тамбовских говорах «топоня» — увалень, неповоротливый человек. Но есть и другой ряд: «топ» — конец, тупик (от «тупик»). В архангельских говорах «топонь» — это «конец», «край». Тогда Топонец — человек, живший на краю села, на отшибе. Эта версия менее очевидна, но географически привязана к северным территориям, где фамилия встречается чаще, чем в средней полосе.

Интересна редкая суффиксальная конструкция: не «Топов» или «Топин» (от имени Топ), а именно «Топонцев». Такое окончание характерно для фамилий, образованных не от имени, а от прозвища с уменьшительным или уничижительным оттенком. Сравните: Кривоногов — Кривоножкин, но Кривоноженцев — уже редкость. Топонцев стоит в этом же ряду.

Географически фамилия привязана к северо-востоку европейской части России: Вологодская, Архангельская области, Коми. В этих краях слово «топоть» (шум, топот) было в ходу, и прозвище Топонец могло закрепиться за шумным, энергичным человеком, а не обязательно за медлительным.

Социальный контекст: фамилия недворянская. Суффикс -ец в основе — признак крестьянской или мещанской среды, где прозвища давали по бытовым чертам. В списках однодворцев и государственных крестьян такие формы встречаются часто.

Если у вас есть семейное предание, что предки были связаны с топонимикой (жили у горы «Топ» или речки «Топонька»), это тоже не исключено: в Архангельской области есть несколько урочищ с корнем «топ-» (топь, топкое место). Но лингвистически надёжнее держаться за прозвище по походке или характеру.