Фамилия Трифильцева — довольно редкая, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Форма на -цев (-цева) указывает на типичную для русских фамилий модель «сын такого-то», но с одной особенностью. В отличие от массовых -ов/-ев, суффикс -цев чаще встречается в прозвищных фамилиях, образованных от названий профессий или прозвищ, оканчивающихся на -ец. То есть Трифильцев — это буквально «сын Трифильца». А Трифилец, в свою очередь, — человек, которого прозвали по имени Трифилий.

Основа фамилии — редкое календарное имя Трифилий (от греческого «трифиллион» — трилистник, клевер). Это имя встречалось в святцах, но в народе было нечастым из-за сложности произношения. В быту его могли переделывать, упрощать, и форма Трифилец — как раз результат такого народного переосмысления с типичным для русских говоров окончанием -ец. Прозвище Трифилец могли дать человеку, который носил это имя, или, что реже, в насмешку — за сходство с растением-трилистником.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям, где имя Трифилий встречалось чаще. Поскольку основа — церковное имя, предки носительницы фамилии могли быть из крестьян или мещан, получивших фамилию по имени деда или отца. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это указывает на её «низовое», бытовое происхождение.

Однокоренных фамилий немного: Трифильев, Трифилов (от той же основы), но форма Трифильцева выделяется именно суффиксом -цев, который делает её более «прозвищной» и приземлённой. Если бы фамилия образовалась напрямую от имени, мы бы имели Трифильев. А Трифильцев — это уже след того, что имя сначала превратили в прозвище, а затем закрепили в роду.

Таким образом, Трифильцева — фамилия, которая рассказывает о предке, носившем редкое календарное имя Трифилий, и о том, как это имя обросло бытовыми формами. Никакой загадки здесь нет, но есть живая история народного словообразования.