Мужское крестильное имя Трифон в переводе с древнегреческого означает «нежный». В основу фамилии легла производная форма имени – Трифиня. Скорее всего, основатель рода Трифининых был представителем простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трифиня, со временем получил фамилию Трифинина.