Основой фамилии Трифоева послужило церковное имя Трифой. Имя Трифой представляет собой вариант мужского имени Трифон, что в переводе с греческого означает «нежный». Скорее всего, основатель рода Трифоевых был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трифой, со временем получил фамилию Трифоева.