Фамилия Трифонова восходит к каноническому мужскому имени Трифон, которое в переводе с греческого означает «нежный». Скорее всего, основатель рода Трифоновых был из богатой семьи. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трифон, со временем получил фамилию Трифонова.