Фамилия Трошунина — женская форма фамилии Трошунин, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем или прозвищем. Основа здесь — Троша, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Трошунин, то есть сын Троши. Троша — это разговорная, народная форма крестильного имени Трофим. В русской традиции имена часто сокращали и переделывали на бытовой лад: Трофим превращался в Трошу, подобно тому как Иван становился Ваней, а Степан — Стёпой. Так что в основе фамилии лежит имя Трофим (греч. «кормилец», «питомец»), но через уменьшительно-ласкательную форму.

Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов, оканчивающихся на -а или -я. Троша дал Трошунин, а не Трошов — это типичная модель для северных и центральных областей России, где такие фамилии встречались чаще, чем на юге. В говорах встречался и вариант Трошков (от Трошка), но Трошунин звучит как более «домашний», патронимический вариант: буквально «сын Троши». Если отец был Троша, его дети становились Трошуниными.

Версия о том, что фамилия могла произойти от прозвища Троша, не связанного с именем, маловероятна. В русской ономастике Троша почти всегда восходит к Трофиму, а не к какому-то иному слову. Иногда встречается связь с глаголом «трошить» (в диалектах — крошить, толочь), но для фамилии это натяжка: прозвище Троша в таком значении не фиксируется в словарях прозвищ.

Социальный контекст: фамилия Трошунин (и Трошунина) недворянская, не княжеская. Она из крестьянской или мещанской среды, где детей записывали по отцу: Иван Трошунин — значит, сын Троши. В переписных книгах XVII–XVIII веков такие фамилии встречаются в центральных губерниях, особенно в Рязанской, Тульской, Владимирской областях. Географическая привязка: сегодня носители фамилии Трошунина рассеяны по России, но наибольшая концентрация — в Пермском крае и Кировской области, что подтверждает её севернорусские корни.

Таким образом, если вы Трошунина, ваши предки по мужской линии, скорее всего, носили имя Трофим, а в быту их звали Трошами. Фамилия не редкая, но и не массовая — она сохранила в себе живую народную форму имени, которая сейчас почти вышла из употребления.