Фамилия Трубенев — редкий случай, когда на слуху сразу несколько версий происхождения, и ни одна из них не кажется натянутой. Словообразовательная модель проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть в основе лежит личное имя или прозвище Трубень. Вопрос в том, что значило это прозвище.

Самая прямая версия — профессиональная. Трубень могло быть прозвищем мастера, который делал трубы: печные, водосточные, музыкальные. В русских говорах слово «труба» имело много значений — от дымохода до узкого прохода или оврага. Человек, живший в конце такого оврага или у «трубы» (пролива, протока), тоже мог получить прозвище Трубень. Однако ремесленная версия выглядит убедительнее: фамилии на -ев от названий профессий (Кузнецов, Столяров, Плотников) — массовое явление, и Трубенев вписывается в этот ряд.

Есть и вторая, менее очевидная гипотеза. В старых псковских и новгородских говорах «трубень» — это нечто вроде «трутня» или «бездельника», но слово редкое и локальное. Ономастический словарь Веселовского фиксирует прозвище Труба и фамилию Трубин, но Трубень в нём не встречается, что говорит о редкости исходной формы. Возможно, это вариант от крестильного имени Трифон (через народную форму Труфон → Трубон → Трубень), но такая цепочка требует допущений.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным областям России — Курской, Воронежской, Тамбовской. В этих краях «трубой» нередко называли не только печную трубу, но и длинный рукав одежды или даже высокого худого человека. Так что предок Трубеневых мог быть либо мастеровым, либо долговязым парнем, либо жителем урочища Труба. Уверенно выбрать одну версию мешает отсутствие массовых письменных источников по этой фамилии — она не дворянская, не купеческая, а крестьянская или мещанская, и её история остаётся в тени более распространённых однокоренных «соседей»: Трубин, Трубников, Трубачёв.