Фамилия Трубышева — редкий случай, когда основа не вызывает споров, но механизм её превращения в фамилию заслуживает отдельного разбора. В отличие от массовых Трубниковых или Трубачёвых, здесь работает модель, характерная для северных и вятских говоров.

Корень — «труба». Но не в значении «дымовая труба» или «музыкальный инструмент», а скорее как прозвище. В русских диалектах «трубой» называли долговязого, худого человека, а также того, кто громко и монотонно говорит — «трубит». Есть и третье значение: «труба» — это водопропускная труба в овраге, и прозвище могли дать человеку, жившему у такого сооружения.

Ключевая особенность — суффикс «-ыш-». В русской антропонимии этот суффикс обычно образует прозвища по характерному признаку: малыш (маленький), глупыш, крепыш. Соответственно, Трубыш — это человек, которого прозвали «трубой»: либо очень худой и высокий, либо обладатель громкого голоса. Суффикс придаёт прозвищу оттенок ласкательности или иронии.

Дальше работает стандартная модель: от прозвища Трубыш образовано притяжательное прилагательное «Трубышев» (чей сын? — Трубышев), а в женской форме — Трубышева. Так что фамилия указывает на прямого потомка человека по прозвищу Трубыш.

Географически фамилия тяготеет к Вологодской, Архангельской и Кировской областям — именно в этих регионах суффикс «-ыш» в фамилиях встречается чаще, чем в средней полосе. В отличие, скажем, от фамилии Трубачёв (где «-ач-» — суффикс деятеля, «трубач»), Трубышев сохраняет именно прозвищный, а не профессиональный оттенок.

Мужской вариант — Трубышев — встречается в несколько раз чаще женского, что типично для фамилий с такой моделью. В документах XVII–XVIII веков эта фамилия не зафиксирована, что говорит о её относительно позднем закреплении — скорее всего, в XIX веке, когда крестьяне массово получали фамилии по уличным прозвищам.