Фамилия Трусакова образована от прозвища или нецерковного имени Трусак. В русских говорах «трусак» — это заяц-русак, особенно в северных и сибирских диалектах. Так могли прозвать человека за быстроту, пугливость или, наоборот, за то, что он «петляет», избегая прямых ответов. Интересно, что в некоторых областях «трусаком» называли не только зайца, но и трусливого, но при этом суетливого человека. Так что фамилия может указывать либо на внешнее сходство с животным (например, быстрые движения, длинные ноги), либо на свойство характера.

По модели образования это типичная русская фамилия на -ов, принадлежащая к «притяжательному» типу: Трусакова — дочь или жена Трусака. Суффикс -ак в основе (Трус-ак) характерен для прозвищ, описывающих человека по яркой черте: Трусак, Глушак, Простак. Такие прозвища часто становились фамилиями без изменений, а потом обрастали патронимическим суффиксом.

В отличие от более распространённой фамилии Трусов, где корень прямо указывает на трусость, Трусакова сохраняет зооморфный оттенок. Вероятно, предок носителя фамилии жил в местности, где зайцев называли именно «трусаками» — это характерно для говоров Архангельской, Вологодской и Пермской губерний. Там же фамилия встречается чаще всего, хотя сейчас рассеяна по всей России.

Мужской вариант — Трусаков — фиксируется в документах XVII–XVIII веков среди крестьян и посадских людей. Это не дворянская фамилия, а скорее «низовая», бытовая. Фамилия не имеет отношения к слову «трус» в современном значении: исходное прозвище было не обидным, а описательным, как и многие другие «звериные» фамилии.