Фамилия Трушнин — из числа тех, что образовались не от крестильного имени, а от прозвища или мирского имени. В её основе лежит слово «трушня», которое в русских говорах означало «тряпка, ветошка», а также «неопрятный, неряшливый человек». Человек, получивший такое прозвище, мог быть небрежным в одежде или вести хозяйство кое-как — прозвища на Руси часто давались по внешним признакам или манере поведения, и они далеко не всегда звучали лестно.

Модель образования проста: к основе «Трушн-» добавился суффикс принадлежности «-ин». В русской антропонимии суффикс -ин (как и -ов/-ев) указывал на родство: Трушнин — это «сын Трушни». Такая форма была особенно распространена в северных и центральных губерниях России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на -ов. Если бы прозвище звучало как Трушня, то фамилия закономерно превратилась в Трушнин.

Существует и менее вероятная, но возможная версия: связь с диалектным глаголом «трушить» — то есть «трясти, сыпать, крошить». В этом случае прозвище Трушня мог получить суетливый или мелочный человек. Однако первое объяснение — от «тряпки» — более прямое и подтверждается типичной для русских фамилий семантикой бытовых прозвищ.

Фамилия Трушнин не относится к числу очень распространённых, но встречается в центральной России и в Поволжье. Её можно спутать с однокоренной фамилией Трушин, но разница в суффиксе указывает на разную основу: Трушин происходит от имени или прозвища Труша (уменьшительное от Трофим или Матвей), а Трушнин — строго от «Трушня». В старых переписных книгах XVII–XVIII веков такую фамилию могли записать как Трушнинъ, с твёрдым знаком на конце, что не меняло её сути.

Таким образом, предки современных Трушниных с большой долей вероятности получили фамилию по прозвищу, которое дали не самому аккуратному или расторопному человеку. Со временем прозвище забылось, а фамилия осталась — и теперь её носители могут считать, что их род начинался с человека, которого в деревне запомнили по какой-то бытовой черте.