Фамилия Трушняев, вероятнее всего, образована от имени Трушняй, которое может представлять собой просторечную форму имени Трифон. В переводе с греческого это имя означает «нежный». Известно, что иногда имя Трифон произносилось как Труфан. Изменение «и» на «у» объясняется тем, что имя Трифон по-гречески писалось через «ипсилон» - букву, которая при переписке русскими писцами передавалась через букву «ижица». Эту редкую букву иногда принимали за «у». Отсюда и двоякое произношение русскими имени Трифон. Уже от имени Труфан возникли формы Труша и Трушеня. Видимо, последнее имя и послужило переходной формой при образовании имени Трушняй. В истории русского православия известно пять святых покровителей имени Трифон. Таким образом, потомок человека, которого звали Трушняй, со временем получил фамилию Трушняев.