Фамилия Трякшин образована от мирского имени Трякша, которое в старину давали не при крещении, а в быту. Такие имена, часто звучавшие непривычно для современного уха, были широко распространены на Руси вплоть до XVII века, пока церковь окончательно не вытеснила их из официального обихода. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Трякшин буквально означает «сын Трякши», «ребёнок Трякши».

Происхождение самого имени Трякша — вопрос, в котором нет полной ясности, и здесь стоит рассмотреть две версии. Наиболее убедительной выглядит связь с мокшанским языком, где слово «тракс» переводится как «корова». Мордовские земли соседствовали с русскими княжествами, и заимствования из финно-угорских языков в прозвищах не редкость. Если принять эту версию, то Трякшей могли называть человека, связанного со скотоводством, либо обладателя какого-то «коровьего» качества — например, спокойного нрава или, наоборот, крепкого телосложения.

Вторая гипотеза отсылает к коми-пермяцкому глаголу «тракйыны» — «дёргать». В этом случае прозвище Трякша могло характеризовать поведение: так могли сказать о суетливом, порывистом человеке, который всё время дёргается, или, напротив, о том, кто дёргал лён, пеньку или коноплю. Подобные «профессиональные» прозвища тоже были широко распространены. Однако эта версия выглядит менее вероятной: коми-пермяцкий ареал удалён от основных территорий расселения русских, и массовых следов такого заимствования в русской антропонимии не прослеживается.

Стоит отметить, что фамилия Трякшин — редкая. Она не встречается ни в старинных боярских списках, ни в купеческих реестрах, что говорит о её простонародном, крестьянском или посадском происхождении. Скорее всего, предки носителей этой фамилии жили на стыке русских и финно-угорских земель — в Поволжье или на Урале, где подобные межэтнические контакты были обычным делом. Там же, в районах со смешанным населением, имя Трякша могло закрепиться и передаваться по наследству, пока не превратилось в фамилию окончательно.

В написании фамилии возможны варианты: Трякшин с буквой «я» в корне — самый распространённый, но в документах XIX века можно встретить и форму Трекшин, где гласная отражает местное произношение. Это лишний раз подтверждает, что фамилия бытовала в устной традиции задолго до того, как её начали фиксировать на бумаге, и единого стандарта написания тогда не существовало.