Фамилия Циликин образована от прозвища Цилик — так в старину называли человека, за которым закрепилось это именование. В основе лежит нарицательное слово, которое в вологодских говорах означало «молодой гриб». Суффикс -ин указывает на принадлежность: Циликин буквально значит «сын Цилика», «из рода Цилика». По такой модели в русском языке строятся фамилии от прозвищ и мирских имён, оканчивающихся на согласный: Цилик → Циликин.

Вероятно, Цилик — это не просто прозвище, а мирское нецерковное имя. В дохристианской и раннехристианской традиции такие имена давали наряду с крестильными, и они нередко отражали черты, обстоятельства рождения или окружающую природу. Называя ребёнка Циликом, родители могли желать ему расти быстро, как молодой гриб после дождя, или, напротив, использовать имя как оберег: в старину верили, что нечистая сила не трогает людей, названных её именем или связанных с ней словом. Прозвище Цилик закреплялось за человеком как наиболее употребительное именование, а со временем легло в основу фамилии Циликин.

Географическая привязка к вологодским говорам — важная деталь: она указывает, что фамилия, скорее всего, зародилась на Русском Севере, где диалектное слово «цилик» бытовало в живой речи. В других регионах основа могла бы звучать иначе, и это делает фамилию локально окрашенной. Однокоренных фамилий с той же основой мало, что неудивительно: редкое диалектное слово редко порождало массовые фамилии.

Точных сведений о дате возникновения фамилии или о конкретных исторических носителях нет — это редкая фамилия, и письменные источники по ней скудны. Но словообразовательная модель прозрачна: прозвище или мирское имя Цилик, суффикс -ин, значение «потомок Цилика». Так что человек с фамилией Циликин может уверенно связывать свой род с северными говорами и с тем, что его далёкий предок носил имя или прозвище, связанное с молодым грибом.