Фамилия Ципис — редкая и неочевидная с точки зрения русского языка. Её происхождение ведёт не в славянскую, а в еврейскую ономастику, а точнее — к языку идиш. Основа фамилии — слово «ципе» (ציפּע), что на идише означает «птичка» (уменьшительно-ласкательное от «ципор» — птица). Суффикс «-ис» в данном случае — это патронимический или локативный формант, характерный для еврейских фамилий, образованных по модели восточноевропейского идиша. Таким образом, Ципис можно перевести как «сын (или потомок) Ципы» или «относящийся к Ципе». Сама же «Ципа» — это женское имя-прозвище, которое давали за лёгкий, подвижный нрав или за внешнее сходство с птахой.

С географической точки зрения фамилия Ципис тяготеет к территории бывшей черты оседлости — современным Украине, Беларуси, Молдове и восточным регионам Польши. В этих местах еврейское население в XVIII–XIX веках массово получало фамилии, и прозвища на основе «птичьего» ряда были популярны: отсюда же Циперович, Ципкин, Ципельман. Ципис — более короткая, «усечённая» форма, без славянского суффикса -ович или -ский.

Словообразовательная модель здесь необычна для русского уха: фамилия не имеет ни привычного -ов, ни -ин. Суффикс -ис — это ашкеназский вариант, который в русской записи закрепился как окончание. В дореволюционных документах можно встретить варианты написания: Циппис, Циписъ, а также Ципес (с другим окончанием, но той же этимологией). Споров о корне почти нет: все версии сходятся на «птичьем» значении. Альтернативное объяснение — от местечка Ципис (гипотетический топоним) — не подтверждается картами и источниками, поэтому его можно отбросить.

Что касается социального статуса, то носители фамилии в XIX веке были в основном мещанами или ремесленниками. Фамилия не принадлежала к раввинским или купеческим династиям — это «фамилия простого человека», которую дали по домашнему прозвищу. Встречается она и сегодня, но остаётся малочисленной: в России, Израиле, США и Германии.