Фамилия Цыбиногин образована от прозвища Цыбинога. Оно представляет собой сочетание двух слов: украинского нарицательного «циба» со значением «длинная нога» и существительного «нога». Таким образом, именование Цыбинога можно трактовать как «длинноногий человек». Вероятно, именование Цыбинога отражает особенности внешности его обладателя. Так могли назвать высокого человека, у которого были длинные ноги. Так и прозвище Цыбинога закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Цыбиногин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Цыбинога, со временем получил фамилию Цыбиногин.