Фамилия Цыбус — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с внешностью или характером, а не с профессией или именем. В ней нет патронимического суффикса -ов или -ин, которые указывали бы на отца: окончание -ус выдаёт в ней «окаменевшее» прозвище, которое закрепилось за родом без дополнительной переделки. Такая модель встречается в основном в западных и юго-западных землях бывшей Речи Посполитой — на Украине, в Белоруссии и в пограничных с ними областях России. Поэтому география фамилии сразу подсказывает, что искать корни стоит не в центральной России, а в регионе, где польский, украинский и белорусский языки влияли на русскую ономастику.

Самая прямая версия связывает Цыбуса с диалектным словом «цыбуля» — так в украинском, белорусском и некоторых южнорусских говорах называют лук. Прозвище Цыбус мог получить человек с характерным запахом, либо тот, кто торговал луком, либо просто обладатель круглой головы или луковичного носа. В пользу этой версии говорит и то, что фамилии от названий овощей встречаются у крестьян и мещан повсеместно: Цыбуля, Цыбульский, Цыбуленко — однокоренные варианты. Но форма Цыбус, с суффиксом -ус, встречается реже и звучит более пренебрежительно или уменьшительно, как «луковка» или «луковый человечек».

Менее вероятная, но не отбрасываемая версия — связь с литовским или балтским корнем. В литовском языке есть слово cibus, означающее «слабый», «хилый», или cibas — «кнут», «плеть». Учитывая, что фамилия бытует в приграничных с Литвой и Белоруссией районах, теоретически она могла возникнуть из балтского прозвища, которое потом обрусело. Однако эта гипотеза слабее: в восточнославянской среде слово «цыбуля» было повсеместно, а балтские заимствования в фамилиях такого типа — редкость, и обычно они имеют более прозрачную форму (например, Цибулькас).

Социальный контекст фамилии прост: Цыбусы в Российской империи относились к крестьянскому или мещанскому сословию. Фамилия не дворянская, не купеческая — её носители были людьми земли или мелкой торговли. Встречается она и сегодня, но остаётся редкой: по открытым данным, наибольшая концентрация — в западных областях России, а также в Белоруссии и на Украине. Изменений в написании практически нет: Цыбус, Цыбуса, Цыбусов — последняя форма встречается, но как вторичная, от отчества, а не исходная.