Фамилия Тубер — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение не лежит на поверхности. Первое, что бросается в глаза, — отсутствие типичных русских суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский). Это сразу подсказывает: перед нами, скорее всего, не исконно русская фамилия, а заимствованная или возникшая в иноязычной среде. По модели образования она напоминает прозвища или фамилии, оставленные без переделки на русский лад.

Самая вероятная версия ведёт к немецкому или еврейскому (ашкеназскому) корню. В немецком языке «Tuber» (от латинского tuber — «клубень», «шишка») могло быть прозвищем человека с характерной внешностью — например, с шишковатым носом или наростом. В медицинском контексте слово означает «бугорок» или «бугор», что в Средневековье нередко становилось основой для прозвищ, данных по заметным физическим особенностям. В среде немецких колонистов, переселявшихся в Россию в XVIII–XIX веках, такая фамилия могла закрепиться без изменений.

Другая версия — профессиональная. В некоторых диалектах немецкого языка «Tuber» связывали с человеком, который выращивал или торговал клубнеплодами (картофелем, репой). Учитывая, что картофель в Европе долгое время был «низкой» культурой, прозвище могло быть ироничным или указывать на крестьянское занятие. Однако эта гипотеза менее убедительна: прямых словарных подтверждений такому значению в немецком нет.

Нельзя исключать и вариант, что фамилия восходит к еврейской фамилии Тубер (Tuber), распространённой среди ашкеназов. В таком случае её основа — идишское или немецкое слово с тем же значением «клубень». В Российской империи еврейские фамилии нередко записывали в документах без изменений, особенно если носитель жил в черте оседлости или в Прибалтике.

Географически фамилия Тубер в России встречается крайне редко, единичные случаи зафиксированы в городах Поволжья и Сибири — регионах, куда активно переселялись немецкие колонисты. В современной Германии фамилия Tuber тоже нечастая, но более узнаваема.

Что касается сословной принадлежности, то, судя по происхождению, предки носителей фамилии могли быть либо крестьянами-колонистами, либо ремесленниками. Дворянских корней у этой фамилии не прослеживается. Для этимолога Тубер интересен именно своей «нерусской» огранкой: он показывает, как язык адаптирует чужие прозвища, оставляя их почти в первозданном виде.