Фамилия Тулькубаева — женская форма фамилии Тулькубаев, которая распространена у башкир и татар. Её основа — тюркское мужское имя Тулькубай, где первая часть «тульку» восходит к слову «төлке» (лиса), а «бай» означает «богатый, хозяин». Таким образом, имя Тулькубай переводится как «богатый, как лиса» или «лисий хозяин». В тюркской антропонимии образ лисы нередко связывали с хитростью, ловкостью и удачливостью — качествами, которые родители желали ребёнку.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединили к тюркской основе. В башкирской и татарской среде такие фамилии на -ев/-ов массово появились в XIX — начале XX века, когда крестьянам и горожанам давали фамилии по имени отца. Тулькубаевы — потомки человека по имени Тулькубай, который, вероятно, жил в одном из юго-восточных районов Башкортостана или в соседних областях Татарстана.

Географически фамилия привязана к Урало-Поволжскому региону. Встречается она нечасто, что говорит о сравнительно узком родовом гнезде. В документах и переписях XIX века имя Тулькубай фиксировали у башкир-вотчинников и тептярей, но сословная принадлежность носителей была разной — от рядовых общинников до зажиточных скотоводов.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — например, Тюлькубаев или Тюлькин, — то Тулькубаева сохраняет более архаичную огласовку имени. Вариант с «ю» мог возникнуть под влиянием русского произношения или местных говоров, но исходная форма с «у» точнее передаёт башкирское «төлке».