Фамилия Тупакова — женская форма от Тупаков, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Тупак. В русской ономастике суффикс -ак часто образовывал имена и прозвища от качественных прилагательных: глухой — Глушак, дикий — Дикак, босой — Босак. Тупак, соответственно, происходит от прилагательного «тупой» — не в современном обидном смысле, а в прямом, предметном: тупой нож, тупой топор, тупой угол. Прозвище могли дать либо человеку с неострым языком (молчуну, нерешительному), либо, что вероятнее, по профессии — тому, кто работал тупым инструментом или постоянно его затуплял, например, точильщику, который имел дело с затупленными лезвиями.

Модель образования проста и типична для восточнославянских фамилий: основа Тупак- плюс патронимический суффикс -ов, означающий «чей?» — сын Тупака. Таким образом, Тупаков — это потомок человека по прозвищу Тупак. Фамилия недвусмысленно вписывается в ряд однокоренных: Тупицын, Тупиков, Туполуцкий. Интересно, что в некоторых говорах слово «тупак» могло означать не только человека, но и предмет — например, тупой конец яйца или тупую сторону лезвия, что добавляет прозвищу бытовой, даже ироничный оттенок.

В географическом плане фамилия Тупаков встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, особенно в Ростовской, Волгоградской и Воронежской областях, а также в украинских землях, где суффикс -ак был распространён шире. Встречаются варианты написания с одной «п» — Тупаков, но двойное «п» в женской форме Тупакова обычно закрепляется в документах при регистрации, хотя этимологически это одна буква.

Сословная принадлежность предков Тупаковых, скорее всего, крестьянская или мещанская. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала, если не считать случайных однофамильцев. В словарях Б. Унбегауна или В. Никонова отдельной статьи о Тупакове нет, но модель полностью соответствует описанным ими закономерностям образования русских фамилий от прозвищ на -ак.