Фамилия Уклеенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которые в XVII–XVIII веках массово закрепились в среде казачества и крестьянства Левобережной Украины. Суффикс -енко изначально имел значение «маленький», «сын» или «потомок», поэтому Уклеенко буквально означает «сын Уклея» или «потомок Уклея». В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Уклей.

Корень «уклей» вызывает два основных толкования, и оба связаны с повседневной жизнью. Первое — от названия мелкой рыбы уклейки (уклеи), распространённой в реках Восточной Европы. В этом случае прозвище мог получить рыбак, торговец рыбой или человек с худощавым, «рыбьим» телосложением. Второе, менее очевидное, но не менее правдоподобное — от слова «уклей» в значении «клей», то есть вещество для склейки. В говорах существовал глагол «уклеить» — заклеить, починить. Прозвище Уклей могли дать мастеру, который занимался склеиванием, например, столяру или сапожнику, работавшему с клеем.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые преобладают в Великороссии, Уклеенко — типично украинская фамилия. Она почти не встречается в старых московских документах, зато её следы можно найти в реестрах запорожских казаков и в метрических книгах Полтавской, Черниговской и Харьковской губерний XIX века. Интересно, что в русском языке рыба называется «уклейка», а в украинском — «уклій» или «уклея», что ещё раз подтверждает южнорусское происхождение прозвища.

Сословная принадлежность первых носителей фамилии, скорее всего, была крестьянской или казачьей. Фамилии на -енко редко давали дворянам (те предпочитали -ский/-цкий), поэтому Уклеенко — фамилия простых людей: ремесленников, рыбаков или хлеборобов. В современной России фамилия встречается, но остаётся редкой, а основная масса носителей до сих пор сосредоточена на востоке Украины.