Фамилия Уркунов образована от прозвища Уркун, которое происходит от устаревшего глагола «уркать» - «урчать, гудеть, бурчать, ворчать». Можно предположить, что прозвище Уркун дали ворчливому, постоянно бубнящему человеку. Возможно, что фамилия имеет балтийский корни и связана с эстонским urke- «пещера». В этом случае прозвище Уркун указывало на место жительства человека или на особенности его характера (например, замкнутость, молчаливость). Наконец, нельзя исключить, что прозвище Уркун было образовано от названия монгольской реки Орхон (Оркун, Уркун, Ургун). В таком случае его мог получить человек, живший на берегу этой реки. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Уркун, со временем получил фамилию Уркунов.