Фамилия Урюпкин — редкий случай, когда основа не очевидна, а суффикс подсказывает путь. Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Урюпкин — это «сын Урюпки». А вот откуда взялось прозвище Урюпка, и есть главный вопрос.

Самая правдоподобная версия связывает прозвище с диалектным глаголом «урюпать» или «урюпиться». В северных и сибирских говорах «урюпаться» означало испачкаться, вымазаться, стать грязным или неопрятным. Соответственно, Урюпкой могли прозвать неаккуратного человека, неряху. В ономастических словарях (например, в работах по русским прозвищам) такая модель встречается: глагол → прозвище → фамилия. Менее вероятна, но возможна связь с гидронимом — рекой Урюп (приток Чулыма, есть и река Урюпка). В таком случае фамилия могла указывать на выходца с берегов этой реки. Но гидронимическая версия слабее: для образования фамилии от названия реки обычно использовали суффиксы -ский или -ев, а не -ин, и форма «Урюпкин» звучит как уменьшительное от личного прозвища, а не от географического названия.

Интересная деталь: фамилия Урюпкин — редкая, её нет в списках массовых русских фамилий. Это говорит о том, что прозвище могло бытовать локально, в пределах одной губернии или даже одной волости. Поскольку суффикс -ин в русских фамилиях чаще всего образовывался от основ на -а/-я (Урюпка), а не на твёрдый согласный, это косвенно подтверждает прозвищное происхождение. Предок носителя фамилии скорее всего был крестьянином или посадским человеком, получившим прозвище за характерную внешность или манеру одеваться, а не за место жительства.