Фамилия Урюпина в своей основе почти наверняка имеет прозвище Урюпа, а не название знаменитого города. Диалектное слово «урюпа» в новгородских говорах означало «неряха, разгильдяй, замарашка», а также «нюня, рева, плакса». Так могли назвать капризного ребенка, но здесь есть любопытный обережный смысл: надеясь, что сын вырастет трудолюбивым и спокойным, родители нарочно давали ему «плохое» прозвище, чтобы отвести беду. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Урюпина — это «дочь или жена Урюпы», а для мужского варианта — «сын Урюпы».

Вторая версия связывает фамилию с топонимом Урюпинск, но здесь важно не путать причину и следствие. Город в Волгоградской области получил имя от казацкого поселка Урюпина, а тот, в свою очередь, — от того же прозвища или фамилии первопоселенца. Поселок возник в 1618 году (по другим данным — в конце XIV века) как пограничная крепость Рязанского княжества. Само название города окутано легендами: одна рассказывает о татарском князе Урюпе, который увяз в болоте во время поединка с Ермаком и был пленен, другая возводит его к слову «уруба» — «у крутого обрыва реки». Но для фамилии Урюпина топонимическая версия вторична: скорее город произошел от человека, чем человек от города.

Известный носитель фамилии — Егор Егорович Урюпин, купец по происхождению, занимавший пост Харьковского городского головы. При нем городская дума успешно оберегала интересы городского сословия, а сам он в значительной мере восстановил его права. Это редкий случай, когда фамилия с «неблагозвучным» прозвищным корнем принадлежала человеку, сделавшему заметную общественную карьеру.