Фамилия Усенеко — яркий пример украинской модели фамилии на -енко, которая в XVII–XVIII веках была распространена в казацкой среде и среди крестьян Левобережной и Слободской Украины. Суффикс -енко изначально указывал на «сына» или «потомка»: Ус — Усенко — Усенеко, где конечное -е- могло появиться из-за диалектного произношения или под влиянием других фамилий на -еко. В основе лежит прозвище Ус.

Само прозвище Ус было очень распространено в старину. Усом могли назвать человека за длинные, заметные усы, которые в украинской и русской традиции считались признаком мужественности и зрелости. В казачестве усы были обязательным атрибутом, и прозвище Ус нередко давали взрослому воину. Альтернативная, менее вероятная версия связывает корень с глаголом «усать» (мочиться) — в этом случае прозвище носило бытовой, сниженный характер, но в ономастике такие случаи фиксируются реже.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Усов, Усенко, Усачёв — показывает, что Усенеко стоит ближе к украинской традиции. В русских землях преобладала форма Усов (с суффиксом -ов), а на Украине — Усенко и Усенеко. Последний вариант мог закрепиться в документах из-за местного произношения: в некоторых говорах -енко переходило в -енеко, как в фамилиях Бондаренко — Бондаренеко.

Географически фамилия Усенеко чаще всего встречается в Черниговской, Полтавской и Харьковской областях, а также в приграничных районах России, куда в XIX–XX веках переселялись украинские крестьяне. Носители фамилии, скорее всего, происходили из казацких или крестьянских родов, не имевших дворянского статуса — фамилии на -енко редко фиксировались в высших сословиях.

Итог: Усенеко — украинская фамилия, образованная от прозвища Ус с патронимическим суффиксом -енко (в диалектной огласовке). Предок мог быть заметным человеком с густыми усами, вероятно, казаком или крестьянином, жившим на территории современной Украины.