Фамилия Устюжанинов прямо отвечает на вопрос, откуда родом предок её носителя: она образована от прозвища Устюжанин, то есть «житель города Устюга». Это один из тех случаев, когда фамилия звучит как паспорт, в котором записана малая родина человека, жившего четыре-пять веков назад.

Основа здесь — топоним Устюг, а точнее Великий Устюг в Вологодской области. Название города составное и прозрачное: он стоит в устье реки Юг, отсюда и «Устюг» — сжатое «устье Юга». Суффикс -анин в прозвище указывает на принадлежность к местности (сравните: Рига — рижанин, Пермь — пермяк), а уже от этого слова обычным для русских фамилий способом, через суффикс -ов, образовалась фамилия Устюжанинов. То есть цепочка выглядит так: устье Юга → город Устюг → житель — устюжанин → сын устюжанина — Устюжанинов.

История города, давшего фамилию, уходит в XII век, когда колонисты из Ростово-Суздальской земли пришли в бассейн реки Юг и низовья Сухоны. Они заложили две крепости: Гледен на высоком мысу у слияния рек и Устюг в излучине левого берега Сухоны. Долгое время город жил под угрозой набегов: его разоряли новгородцы, галицкие князья Василий Косой и Дмитрий Шемяка, вятичи и казанские татары. Деревянные стены после каждого набега отстраивали заново, и последние укрепления устюжане ставили уже в 1613 году.

Но в историю России Устюг вошёл не только как крепость. С XVII века, когда началось освоение Сибири, именно устюжане стали главными поставщиками хлеба и товаров за Урал. Десятки жителей города ежегодно уходили в Сибирь: заводили соляные варницы, пахали землю, строили остроги и церкви. Из этой среды вышли знаменитые землепроходцы — Семён Дежнёв, Ерофей Хабаров, Владимир Атласов, Тимофей Булдаков. Так что предок человека с фамилией Устюжанинов мог быть не просто горожанином, но и участником великих географических открытий.

Стоит отметить, что фамилия Устюжанинов встречается реже, чем, скажем, Устюгов или Устюжанов, хотя корень у них общий. Форма с суффиксом -анинов архаичнее и точнее передаёт исходное прозвище, что делает её особенно интересной для тех, кто ищет свои корни.