Фамилия Вагнерубов — один из тех редких случаев, когда в русском родовом имени соединились сразу два языка: немецкий и русский. В основе лежит немецкая фамилия Вагнер (Wagner), которая означает «каретный мастер» или «тележник» — ремесленник, делавший повозки. В России фамилия Вагнер была распространена среди обрусевших немцев, а также могла достаться русскому мастеровому, работавшему у немцев или получившему прозвище за сходство с ними.

Вторая часть — «рубов» — добавляет к этому совершенно русский суффикс принадлежности -ов. Но здесь есть важный нюанс. Обычно фамилии на -ов образуются от личных имён, прозвищ или профессий: Иванов, Кузнецов. В случае Вагнерубов мы видим сращение двух основ: «Вагнер» и «руб». Что такое «руб»? Это сокращение от «рубать», «рубить». Вероятнее всего, «Руб» — это русское прозвище, которое мог получить плотник, дровосек или солдат с рубящим оружием. Таким образом, фамилия Вагнерубов — это не просто «сын Вагнера», а «сын Вагнера-Руба», то есть человека, которого звали двойным прозвищем — по ремеслу (немецкому) и по действию (русскому).

Есть и более прозаическая версия: фамилия могла возникнуть в среде русских немцев, когда к уже существующей немецкой фамилии добавили русский патронимический суффикс. То есть некоего Ивана Вагнера в документах могли записать как «Вагнеров», а потом, по аналогии с фамилиями вроде Рубцов (от «рубец»), появился вариант с «рубом». Однако «руб» здесь не связан с рублём — это именно глагольная основа, как в фамилиях Рублёв (от «рубль» — обрубок) или Рубакин.

Географически фамилия крайне редкая. Встречается она в основном в Поволжье и на Урале — регионах, куда в XVIII–XIX веках активно приглашали немецких колонистов. Носители Вагнерубов, скорее всего, потомки тех самых мастеров-каретников, которые со временем смешались с русским населением и получили «гибридную» фамилию, отразившую двойное культурное наследие.